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  1. 具有分析和转换谱系数据功能的包。 系谱是一个 data.frame 格式,其中第一列包含ID,第二和第三列包含第一和第二父代的标识。
    这是否有帮助?
  2. PED - Pedigree format - GATK

  3. 从零开始进行单倍型分析之geneHapR数据准备(上)_genehapr怎 …

  4. LepMap3的使用方法说明 - Bioinformatics dōjō

    2017年10月1日 · vcf文件. vcf文件必须有likelihood信息,lepmap会用likelihood信息进行分析. pedigree文件. pedigree文件包含了样本名及家系等相关信息,pedigree文件为tab分隔的文本文件,示例如下:

  5. 群体遗传之ped格式 - 发那个太丢人 - 博客园

    2019年12月15日 · PED文件格式是广泛使用的用于连锁系谱数据分析的格式,并用作plink程序的输入。PLINK是一个免费的,开源的全基因组关联分析工集,旨在以高计算效率的方式执行一系列基本的,大规模的分析。PED能够处理二倍 …

  6. PLINK 1.9 / 2 基本使用方法 – GWASLab – GWAS实验室

    2021年3月28日 · Plink 是全基因组关联分析中最为常用的软件,其主要用途是对于原始数据的QC质控(relatedness, population structure等),数据格式转换(ped/map, bed/bim/fam, VCF, bgen等),基础数据的计算与统计 …

  7. visPedigree使用指南 - 淡泊明志/宁静致远

  8. 常规遗传评估需要的数据格式和整理步骤 - 淡泊明志/宁 …

    2019年6月3日 · 育种数据分析,主要用到2个文件,系谱文件和数据文件。. 如果开展基因组选择,会使用基于分子标记信息的G或者H矩阵或者逆矩阵文件。. 在ASReml中,通常以稀疏矩阵格式提供(三列)逆矩阵文件。. 系谱文件和数 …

  9. GitHub - phenotips/open-pedigree: A free and open …

    Open Pedigree is a robust browser-based genomic pedigree drawing solution using Prototype, Raphaël, and PhenoTips. Features Robust support for complex families, intergenerational linkages, and consanguinity

  10. pedigree package - RDocumentation

  11. 数据格式(七)——map/ped - 知乎 - 知乎专栏

  12. 某些结果已被删除